Университетте «2018-2022 жылдарға арналған Қазақстан-Американдық еркін университетінің ғылыми-зерттеу қызметінің болашақ жоспары» құрастырылған, оның негізінде жыл сайынғы оқу жылына арнап «ҒЗЖ тақырыптық жоспарлары» құрастырылады.

Қазіргі уақытта университеттің ғылыми-зерттеу қызметі 9 ғылыми жоба шеңберінде жүзеге асырылуда. Ғылыми жобалардың тақырыптары ШҚО мен Қазақстан Республикасының экономикалық, техника-технологиялық, әлеуметтік, білім беру, заң, үштіліділікті дамыту және басқа да өзекті мәселелелерінің шешімін іздеу төңірегін қамтиды:

1. Интеграциялық үрдістер мәнмәтініндегі Қазақстан заңнамасын дамыту және оның унификациясы мәселелері – жетекші – з.ғ.к. Гаврилова Ю.А., мемлекеттік тіркеу № 0113РК01209

2. Қаржылық жаһанданудың қазақстандық банктердің даму стратегиясына әсері – жетекші – экономика және бизнес докторы Бордияну И.В., мемлекеттік тіркеу № 0113РК01211

3. Аударманың прагматикалық және мәдениаралық аспектілері – ғылыми жетекші – ф.ғ.к. Чжан Е.Е., мемлекеттік тіркеу № 0113РК00223

4. Аймақтық экономикалық интеграцияның өзекті мәселелері – ғылыми жетекші – т.ғ.д. Ирмуханов Б.Б., мемлекеттік тіркеу № 0113РК00224

5. Түрлі әлеуметтік салалардағы жыныстық теңдіктің қалыптасу үрдісінің психологиялық сүйемелденуі мәселесі – ғылыми жетекші – пс.ғ.д. Ладзина Н.А.., мемлекеттік тіркеу № 0113РК00225.

6. ҚР инновациялық жүйесіндегі интеграциялық үрдістердің ұйымдастыршылық – экономикалық механизмдері – жетекші – э.ғ.к. - Конопьянова Г.А., мемлекеттік тіркеу № 0117РКИ018

7. Қоғамдық жаһандық ақпараттандырылуы жағдайындағы компьютерлік модельдеу әдістерін қолданудың әлеуметтік – экономикалық үрдістерін зерттеу – жетекші - қ.-м.ғ.к. Попова Г.В., мемлекеттік тіркеу № 0117РКИ0181

8. Орта және жоғарғы мектеп жүйесіндегі үштілді білім беруді енгізудің ұйымдастырушылық- әдістемелік әдістері – п.ғ.к. Кикина М,И., мемлекеттік тіркеу № 0117РКИ0179

9. Шет тілінің әртүрлі аспектілерін оқытудың коммуникативті әдістемесі – ғылыми жетекші - MEd Новицкая Ю.В., мемлекеттік тіркеу № 0113 РКИ 01210